|
6
Поступила в редакцию 22.12.2016
Подписана в печать 13.03.2017
14 с.
/r1/pdf.jpg)
PDF |
А. А. Рыбаков
Внутреннее представление и механизм межпроцессного обмена для
блочно-структурированной сетки при выполнении расчетов на
суперкомпьютере
В статье рассматривается внутреннее представление
блочно-структурированной сетки, описание основных ее объектов и
взаимодействие их между собой. Также рассматривается механизм
организации межпроцессного обмена данными, при выполнении расчетов
на суперкомпьютере.
Ключевые слова:
суперкомпьютер; математическое моделирование;
блочно-структурированная расчетная сетка; внутреннее представление;
межпроцессный обмен. |
|
12
Поступила в редакцию 18.12.2016
Подписана в печать 20.03.2017
24 с.
PDF |
Е. В. Кулакова, А. М. Спицина, А. Г. Богомолов, Н. Г.
Орлова, А. И. Дергилев, И. В. Чадаева, В. Н. Бабенко, Ю. Л. Орлов
Программа анализа геномного распределения хромосомных контактов в
ядре клетки по данным, полученным по технологиям ChIA-PET и Hi-C
В связи с ростом объемов данных геномики о положении
сайтов связывания транскрипционных факторов, хромосомных контактах,
аннотации геномных характеристик, полученных с помощью современных
технологий секвенирования, растет потребность в разработке нового
программного обеспечения для их статистической обработки и анализа.
Рассмотрены технологии получения и программы анализа геномных данных
секвенирования на основе технологий ChIA-PET и Hi-C. Представлена
разработанная компьютерная программа для обработки геномных данных о
хромосомных контактах и их функциональной аннотации.
Ключевые слова: биоинформатика, секвенирование,
суперкомпьютерные вычисления, хромосомные контакты, графический
интерфейс, базы данных. |
/r1/pdf.jpg){kind=small}
.