|
|
 |
• Содержание выпуска •
• Методы оптимизации и теория управления •
• Математическое моделирование •
• Программное и аппаратное обеспечение распределенных и суперкомпьютерных систем •
• Математические основы программирования •
Программное и аппаратное обеспечение распределенных и суперкомпьютерных
систем
Ответственный за рубрику: д.ф.-м.н., чл.-корр. РАН Абрамов С.М.
Слева для каждой статьи показаны: присвоенный статье порядковый номер;
дата поступления статьи в
редакцию; количество страниц статьи в
формате А5; ссылка на полный текст статьи в формате PDF
/r1/pdf.jpg) .
|
16
Поступила в редакцию 17.04.2017
Подписана в печать 15.05.2017
24 с.
/r1/pdf.jpg)
PDF |
А. М. Спицина, А. О. Брагин, А. И. Дергилев, И. В.
Чадаева, Н. Н. Твердохлеб, Э. Р. Галиева, Л. Э. Табиханова, Ю. Л.
Орлов
Компьютерные средства анализа транскриптомных данных: программный
комплекc ExpGene
Технологии высокопроизводительного секвенирования ДНК позволяют
получать данные экспрессии генов в масштабе генома, как на
микрочипах, так и на основе транскриптомного профилирования.
Необходимо развитие новых компьютерных методов анализа таких данных,
опирающихся на суперкомпьютерные технологии. Рассмотрены задачи
анализа транскриптом в контексте вычислительной сложности.
Представлены примеры применения программного комплекса ExpGene для
статистической обработки и визуализации транскриптомных и
микрочиповых данных. Показаны приложения для анализа транскриптом
отделов мозга лабораторных животных.
Ключевые слова: биоинформатика, программный
комплекс, секвенирование ДНК, транскриптом, экспрессия генов,
микрочипы, базы данных. |
|
Ссылка на статью обязательна |
http://psta.psiras.ru/read/psta2017_2_45-68.pdf |
|
цифровой идентификатор
статьи DOI |
https://doi.org/10.25209/2079-3316-2017-8-2-45-68 |
• Содержание выпуска •
• Методы оптимизации и теория управления •
• Математическое моделирование •
• Программное и аппаратное обеспечение распределенных и суперкомпьютерных систем •
• Математические основы программирования •
|
